Восточная Малайзия омывается на севере Южно-Китайским морем и морем Сулу, на востоке — Целебесским морем, и на юге и западе — Калимантаном (Индонезийский Борнео). Вдоль побережья в пределах штата Саравак расположена независимая страна Бруней. И у Восточной, и у Западной Малайзии есть гористые внутренние области и прибрежные равнины. Самый высокий пункт — гора Кинабалу (13 455 футов/4,101 м.) в Сабахе. Самыми длинными из многочисленных рек страны являются  Раджанг (350 ми/560 км) в Сараваке, Кинабатанган (350 ми/560 км) в Сабахе, и Паханг (200 ми/320 км) в Западной Малайзии. В приэкваториальных областях Малайзии есть влажные тропические леса, и преобладает влажный тропический климат. Более чем две трети площади покрыты лесами.

Хотя Западная Малайзия занимает только 31 % площади страны, на ее территории проживает больше чем 80 % населения страны. Из общего числа населения, большая часть которого сконцентрирована на западном побережье, приблизительно 50 % — этнические малазийцы, почти 25 % — китайцы, более чем 10 % происходят из местных племен, и приблизительно 7 % — выходцы из Южной Азии (главным образом, тамильцы).

В Западной Малайзии малайцы составляют приблизительно половину населения, китайцы — одну треть, и одну десятую — выходцы из Южной Азии. В Восточной Малайзии две самых больших группы — китайцы и Ибаны (народ группы Дьяков), коренные жители, которые вместе составляют приблизительно три пятые от общей численности населения.